Han studerade humaniora hos jesuiterna och teologi hos dominikanerna. Han prästvigdes 1676 och verkade under flera år i Kanara-regionen i södra Indien.

Efter nästan tio år i Kanara återvände han till Goa, och 1686 grundade han där ett oratorium tillägnat den helige Filippus Neri tillsammans med en grupp andra präster, med råd och hjälp från de oratoriska husen som då fanns i Portugal. Bara ett år senare, 1687, kände han sig kallad att lämna Goa och åka som missionär till ön Ceylon, nuvarande Sri Lanka.

Han stannade på ön i tjugofyra år och utövade sitt prästämbete under mycket svåra omständigheter. Han förföljdes och förtrycktes hårt av de undertryckande nederländska kalvinistiska myndigheterna, som ville sätta stopp för hans ensamma men framgångsrika ansträngningar att återuppbygga kyrkan och hålla katolicismen vid liv på Ceylon. Han var tvungen att resa överallt i förklädnad och tvingades fira sakramenten i hemlighet på natten.

Fader Vaz beslutade sig för att etablera sin bas i kungariket Kandy i öns inre. Vid sin ankomst dit arresterades han som spion och sattes i fängelse. Han släpptes efter att han hade bett om och åstadkommit vad som av alla betraktades som ett mirakulöst regn, vilket satte punkt för en långvarig torka. Därefter gav den buddhistiske kungen av Kandy honom sitt personliga beskydd.

År 1696 anslöt sig flera präster från Oratoriet i Goa till honom på Ceylon, och en ordentligt organiserad mission etablerades där. Fader Vaz avböjde posten som apostolisk vikarie och föredrog att förbli en enkel missionspräst. Bland sina övriga pastorala uppgifter översatte han en katekes och böner till de lokala språken, singalesiska och tamil. Folket kallade honom ”Sammanasu Swam” – den änglalika prästen.

I början av 1711 insåg han att han var döende. Den 16 januari mottog han de sista sakramenten med medlemmar av sin församling samlade kring hans säng. Han sade till dem: ”Lev alltid enligt Guds ingivelse.” Han avled vid midnatt. Han var sextio år gammal.

Tyvärr är det osäkert var hans kvarlevor befinner sig.

Han saligförklarades i Sri Lanka av påven Johannes Paulus II den 21 juni 1995 och helgonförklarades där av påven Franciskus onsdagen den 14 januari 2015.

Hans minnesdag firas den 16 januari.