Guerra Junqueiro on elänyt erikoisen elämän, sillä hän on ollut monarkian ja kirkon vastaisen liikkeen äänitorvi. Myöhemmin hän teki sovinnon kirkon kanssa ja kirjoitti yksinkertaisesta elämästä.

Siitä huolimatta hänen vaikutuksensa näkyy hyvin historiassa. Hänen teoksensa olivat polttoainetta tulelle, joka lopetti Portugalin monarkian vuonna 1910, ja hänen perintönsä muistetaan kansallisessa pantheonissa.